Funkciju īstenošanā ministrija sadarbojas ar valsts un pašvaldību institūcijām, kā arī Sabiedrības integrācijas fondu, dažāda veida darbības jomu nevalstiskajām organizācijām - interešu aizstāvības, mazākumtautību, kultūras, iecietību un cilvēktiesību attīstību veicinošām u.c.
Diskriminācijas novēršanas jautājumos ministrija pārstāv Latviju Eiropas Savienības Pretdiskriminācijas valdības ekspertu grupā, kuras uzdevumos ietilpst veicināt sadarbību starp dalībvalsts atbildīgajām institūcijām diskriminācijas novēršanas jautājumos, veicinot labās prakses un pieredzes apmaiņu starp dalībvalstīm.
Sabiedrības integrācijas departaments ir Eiropas Drošības un sadarbības organizācijas Nacionālo naida noziegumu kontaktpunktu tīklā, kas atbildīgs par informācijas apkopošanu par naida noziegumiem Latvijā, kā arī labās prakses popularizēšanu par jautājumiem, kas saistīti ar iecietības veicināšanu un naida kurināšanas novēršanu.
